Manga Kimi wa 008 yang dibuat oleh komikus bernama Matsuena Shun ini bercerita tentang Akashi Eito telah gagal total dalam semua ujian masuk sekolah menengah, tetapi entah bagaimana, dia menerima surat penerimaan dari sekolah yang tidak pernah dia lamar. Dia tetap dengan senang hati mendaftar, berharap untuk menjalani kehidupan sekolah yang ideal, tetapi aspirasinya dengan cepat hancur saat dia menemukan bahwa sekolah misterius ini adalah lembaga pelatihan untuk agen rahasia! Segera, Eito ingin kembali ke rumah dan menjalani kehidupan normal bersama keluarga normalnya, sampai direktur sekolah membuat pernyataan yang mengejutkan: Ayah almarhum Eito juga seorang agen rahasia! Dia kemudian ingin tahu lebih banyak tentang masa lalu dan kenangan ayahnya, jadi dia memutuskan untuk tinggal di sekolah ini. Namun, sebagai murid dari institusi ini, Eito harus menghadapi ujian mematikan yang dibuat untuk menguji kemampuan semua murid baru ... Ikuti kisah aksi dan spionase ini, di mana pahlawan kita, yang tidak memiliki kekuatan fisik, mengimbanginya dengan keberanian besar, dan memikat semua orang di sekitarnya dengan kekuatan keberanian dan persahabatannya !!